The CNIC Genomics Unit´s work contributes to research projects led by both CNIC groups and other centers, inside and outside Spain, including:
- Spanish National Cancer Research Center (CNIO). Madrid
- Research Institute Hospital La Princesa. Madrid
- Research Institute Hospital Ramón y Cajal. Madrid
- Research Institute Hospital Gregorio Marañón. Madrid
- Research Institute Hospital La Paz. Madrid
- Research Institute Hospital Fuenlabrada. Madrid
- Fundación Jiménez Díaz University Hospital Health Research Institute. Madrid
- Biodonostia Health Research Institute. San Sebastián, Gipuzkoa
- Centro Nacional De Microbiología ISCIII. Madrid
- CSIC- Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa". Madrid
- CSIC- Real Jardin Botánico. Madrid
- CSIC- Centro Andaluz de Biología del Desarrollo. Sevilla
- CSIC- Centro Nacional de Biotecnología (CNB). Madrid
- Centro de Investigación Médica Aplicada (CIMA). Pamplona, Navarra
- Fundació Bosch i Gimpera. Universitat de Barcelona
- Universidad Autónoma de Madrid
- Universidade do Algarve. Portugal
- Universidad Pablo de Olavide. Sevilla
- Universidad de Jaén
- Ankara University. Turquía
- Universidad de Santiago de Compostela- Centro Singular de Investigación en Medicina Molecular y Enfermedades Crónicas (CiMUS).
- Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Hamburg, Alemania
- Institut National des Sciences Appliquées (INSA). Toulouse, Francia
- Généthon. Francia
- Expedeon. Madrid